正亲町天皇之所以敢召集兵马对付幕府，主要是岛津忠直在和朝廷讨价还价，一开始朝廷给出的是关白的位置，但是关白之位不是什么人都能做的。
岛津忠直一眼能看出这是没有诚意的条件，天子会这么傻吗？这不过是天子的一次试探罢了。
所以岛津忠直希望天子可以赐下一个与五摄家同等家格的姓氏，如此就可以当关白了。当然这也是忠直给天子的虚招。
双方还在接洽，但是天子要对幕府动手的野心是藏不住了。
不过对于岛津忠直要做关白一事，摄关家的几位公卿是强烈反对，毕竟要是岛津忠直做了关白，以后这位置还不是岛津辉忠的？然后岛津家代代相传。
若是朝廷没有实权也就罢了，朝廷恢复了实权，这可是割走了摄关家的心头肉。
于是朝廷和岛津忠直这边谈起了新的条件，那就是由岛津忠直成为新的征夷大将军，不过幕府要搬迁到关东去，而且以后朝廷掌管本州的京畿西国，四国和九州，而岛津家掌管东国，陆奥以及虾夷岛。
经过这番谈判，岛津忠直这才松口同意与朝廷合作。
永禄七年七月八号，这是不同寻常的一日，天子突然下达讨伐幕府的诏令，宣布足利幕府为朝敌叛贼。
诏书一经颁布，顿时让附近诸侯哗然，而皇室与公卿们十分兴奋。
朝廷募集了四千兵马，从京都出发进攻二条御所，御所内的三渊藤英等人急忙召集兵马，仅有一千多奉公众进入城内笼城备战。
朝廷大军与幕府军立刻展开激战，双方暂时不分胜负。
这时候菊亭晴季跑来，带来了天子册封岛津忠直征夷大将军的诏令，并让他速速起兵平叛。
岛津忠直大喜，这诏令可是有天子亲笔书写，又有玉玺大印，如此足利幕府的正统性被朝廷否定。
而他岛津忠直可以开新的的幕府。
这一年多来的折腾总算没有白费，他总算是离间了幕府与朝廷，让他们互相攻伐，如今还将足利幕府的正统性剥夺，接下来只要降服足利义直，他就可以开幕。
虽然说自己这个幕府将军暂时不能治理全国，但是他可以顶着幕府将军的旗号办事了。到时候，上杉谦信还会与他作对吗？
不过他好像是足利幕府的关东管领吧？他开幕不就是岛津幕府，这本朝的主君如何管得了前朝的官？要遭，上杉谦信估计要和他死斗了！
当然这也是以后的事了，征夷大将军的印玺并没有送来，如今还在足利义直的手中。
岛津忠直当即率领一万余岛津军协助朝廷大军，包围二条御所，新田义信抵达城外，喊道：“我乃征夷大将军殿下的使臣，前来与足利大人谈判！”
城墙上，明智光秀大怒道：“马鹿野郎！征夷大将军乃足利大人！”
新田义信笑道：“明智大人，如今朝廷已经让殿下担任征夷大将军，况且如今的足利大人兵不过万，困守一城，天下诸侯有几人跟随，如此将军有何威严，而殿下雄兵五万，领国百万石，实力雄于众诸侯，如今得朝廷正朔认可，比起足利大人更有资格当征夷大将军。”
“况且当年足利大人的先祖不也是背叛了镰仓府？在朝廷和天子的支持下担任征夷大将军之位？你足利做的，殿下自然也做的。明智大人最好去问问足利大人，若是负隅顽抗，就休怪殿下不念旧情了！”
明智光秀大恼，但是也不敢担下此事，他立刻对身边的明智光春说道：“左马助，你在这看着，我亲自去汇报。”
明智光秀连忙跑回御馆，向三渊藤英和足利义直等人汇报此事，大部分幕臣脸色惨白，三渊藤英和细川藤孝也是相顾无言。
年幼的足利义直说道：“事已至此，也没必要做无谓的挣扎，若是侍中能佑我足利家宗祠，我愿投降。”
明智光秀跑到前面将新田义信带进来，面见足利义直，随后商讨投降的条件，经过一日的谈判，岛津忠直接受了足利家提出的条件，足利义直出城投降，并上交将军的金印。
足利义直改名为近卫义直，这是他母族的姓氏，足利义直的母亲是近卫殖家的养女，来自鹰司家的子嗣。
不过等岛津忠直统一整个和之国，足利义直的子嗣就可以改回足利氏。
同时足利义辉的女儿昭姬将作为次子熊若丸正室，待年长后就可成亲。
岛津忠直入主二条御所成为征夷大将军，继位的仪式定在明年，在这期间他可以广发书信，邀请各地诸侯前来参拜。
不过三好家第一个不承认岛津忠直是将军，他还打出足利义直的旗号，要光复足利幕府。
岛津忠直立刻联合松永久通出兵，进攻摄津，打的三好义继和三好三人众连连败退。
被三好家击败的田山高政连忙投靠岛津忠直，希望能夺回河内一国。
岛津忠直连连战胜三好家，田山高政拿着岛津忠直资助的钱粮返回河内国，再一次召集旧臣，雇佣根来众和杂贺众出兵，攻打河内国的游佐信教等人。
而在关东，上杉谦信决心不再理睬京畿的事情，致力于越后以及关东的发展，北条家在上杉谦信离开后就和里见家打了第二次国府台合战，里见家先胜后败，而北条家也战死了富永直胜等大将。
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